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2020年中国CRISPR/Cas9行业概览
2020年中国CRISPR/Cas9行业概览

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发布时间

2020-2-19 00:00

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  TALEN ZFN CRISPR/Cas9
靶点DNA序列识别区域 重复可变双残基(RVD)的重复 锌指(ZF)结构域 CRISPR RNA(crRNA)或向导RNA(gRNA)
DNA剪切 Fokl核酸酶结构域 Fokl核酸酶结构域 Cas9蛋白
典型核酸酶构建 8-31个重复可变双残基的拼接 通过搜索各类ZF组合数据库,拼接3-4个ZF结构 gRNA的寡核苷酸合成和分子克隆(或RNA合成)
所识别靶点大小 (8-31bp)*2 (9-12bp)*2 20bp+NGG*1
最小模块识别碱基数量 1 3 1
优点 设计较ZFN简单,特异性高 平台成熟、效率高于被动同源重组 靶向精确、脱靶率低、细胞毒性低、廉价简便
缺点 细胞毒性、模块组装过程繁琐、需要大量测序工作、成本高昂 设计依赖上下游序列、脱靶率高、具有细胞毒性 靶区前无PAM则不能切割、特异性不高、NHEJ会产生随机毒性
基因修饰率 0-34% 51-79%
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